Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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