Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms