Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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