Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK16Q00536 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms