Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPCAP84074 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms