Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms