Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms