Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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