Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5DP30049 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms