Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNA2P26232 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms