Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGCP20142 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGCP20142 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGCP20142 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGCP20142 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGCP20142 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGCP20142 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGCP20142 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGCP20142 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms