Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms