Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00032P0C843 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms