Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATE1O95260 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATE1O95260 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATE1O95260 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms