Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCO2O43819 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms