Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF208O43345 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF208O43345 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF208O43345 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF208O43345 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms