Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms