Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DXG7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms