Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3CA6NKF2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms