Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEMP2A6NFY4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms