Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms