Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCML1Q9UN30 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms