Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms