Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSEQ9UL01 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSEQ9UL01 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms