Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms