Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms