Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms