Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms