Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms