Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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