Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms