Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPA33Q99795 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPA33Q99795 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPA33Q99795 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPA33Q99795 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms