Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms