Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms