Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCL2Q8N4E4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCL2Q8N4E4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms