Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms