Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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