Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms