Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms