Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC27A4Q6P1M0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms