Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms