Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITRM1Q5JRX3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms