Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms