Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms