Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q499Y3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q499Y3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q499Y3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q499Y3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms