Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms