Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Q1T7F1 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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