Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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