Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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