Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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